Kot je v vladnem sporočilu navedlo ministrstvo za infrastrukturo, se program spreminja in dopolnjuje predvsem v delu, ki se nanaša na spremembo ocenjene vrednosti naložb, v največji meri zaradi višjih cen na trgu in priprave višje ravni projektne dokumentacije. Strokovne podlage za spremembe je pripravila Luka Koper, usklajene so z Upravo RS za pomorstvo.

Nekaterih naložb ni več v dokumentu, ker upoštevajoč analizo trga niso potrebne oz. bodo izvedene pozneje, dodane pa so nekatere nove. Te so med drugim povezane z izvedbo projekta drugega železniškega tira Divača-Koper, in sicer ureditev dodatnih površin na kontejnerskem terminalu ter izgradnja pristaniške infrastrukture za namen elektrifikacije in zagotovitve dodatnih površin za projektni tovor, navaja ministrstvo.

Med investicijami v noveliranem programu je izvedba dveh faz dograditve garažne hiše za avtomobile, k čemur je danes vlada v ločeni odločitvi dala soglasje. V fazi 2b je predviden objekt površine okoli 178.000 kvadratnih metrov, v fazi 2c pa objekt površine 48.600 kvadratnih metrov, v dograjenem delu, ki naj bi bil končan marca 2028, bo predvidoma lahko skladiščenih 11.665 avtomobilov.